钼酸铵主要用于肥料、颜料、色淀和织物防火剂、粉末冶金、照相、陶瓷、釉彩、染料以及生产其他钼化合物原料等方面。用于冶炼钼铁和制取三氧化钼、金属钼粉作为钨钼合金、钼丝的原料;其次是用于作化工的催化剂;少量用作农用钼肥;极少量用于医药方面,为多种酶的组成部分,钼的缺乏会导致龋齿、肾结石、克山病、大骨节病、食道癌等疾病。 主要用于长期依赖静脉高营养的患者。